5 Módulo 3 | Exploração de dados
5.1 SETUP
Limpar o ambiente
5.1.1 Instalar e carregar bibliotecas
Sempre que se inicia uma nova sessão, as bibliotecas têm de ser carregadas.
Código
# Forma alternativa de instalar vários pacotes e carregá-los
# SOURCE: https://cedricscherer.netlify.app/2019/05/17/the-evolution-of-a-ggplot-ep
# Packages
required_packages <- c("janitor",
"tidyverse",
"rio",
"data.table",
"lubridate",
"ggplot2",
"gt",
"skimr",
"DataExplorer"
)
for (pkg in required_packages) {
# install packages if not already present
if (!pkg %in% rownames(installed.packages())) {
install.packages(pkg)
}
# load packages to this current session
library(pkg, character.only = TRUE)
}
remove(required_packages)
remove(pkg)5.2 Importação de dados
Para esta parte da aula não será tão importante alguns passos de data cleaning e data wrangling.
Carregar e limpar os dados
Continuamos a trabalhar os dados hospitalares.
inpatient_hospital <- import("datasets/atividade_internamento_hospitalar.xlsx") |>
clean_names()
inpatient_hospital_lite2 <- inpatient_hospital |>
select(
periodo,
instituicao,
tipo_de_especialidade,
doentes_saidos,
dias_de_internamento
) |>
mutate(
length_patient =
round((dias_de_internamento/doentes_saidos), digits = 1),
new_var = 2,
fonte = "transparencia_sns",
multiplicacao = dias_de_internamento*doentes_saidos,
periodo=paste0(periodo, "-01"),
periodo=as.Date(periodo, format = "%Y-%m-%d"),
year = year(periodo),
month=lubridate::month(periodo, label = FALSE),
week=week(periodo),
weekday=lubridate::wday(periodo, label=TRUE),
tipo_instituicao =
case_when(
grepl("Universitário", instituicao, ignore.case = TRUE) ~ "University",
grepl("Oncologia", instituicao, ignore.case = TRUE) ~ "Cancer hospital"
),
tipo_instituicao =
replace_na(tipo_instituicao, "Hospital")
)
inpatient_hospital_surgery_less_500 <- inpatient_hospital_lite2 |>
filter(tipo_de_especialidade=="Especialidade Cirurgica" &
dias_de_internamento<=500)
covid_inc <- import("datasets/covid_inc.csv")|>
clean_names()
hypoxia <- import("datasets/hypoxia.xlsx")|>
clean_names()5.3 Análise Exploratória de Dados (EDA)
A Análise Exploratória de Dados (EDA, do inglês “Exploratory Data Analysis”) é uma etapa fundamental e dinâmica no processo de análise de dados. Mais do que um conjunto de procedimentos rígidos, a EDA é um processo criativo e iterativo de exploração e compreensão dos dados.
“Não existem perguntas estatísticas rotineiras, apenas rotinas estatísticas questionáveis.” — Sir David Cox
A EDA é motivada pela curiosidade e guiada pelos dados disponíveis, sendo essencial na avaliação da qualidade dos dados e na geração de insights valiosos.
Processo Iterativo de EDA
Formulação de Perguntas a Partir dos Dados: Levante questionamentos baseados nos dados disponíveis. Este passo é crucial para direcionar a análise.
-
Exploração dos dados:
- Visualizações: Use gráficos e visualizações de dados para avaliar tendências, padrões e anomalias.
- Transformações de Dados: Manipule e transforme os dados para melhor compreensão e análise.
- Modelos: Aplique modelos estatísticos simples para testar hipóteses e explorar relações.
Reflexão e Aprofundamento: Reflita sobre o que foi aprendido com as análises iniciais. Use esses conhecimento para melhorar as perguntas existentes ou formular novas.
Pré-requisitos
Conhecimento dos Dados: Conheça o dataset em profundidados entenda as variáveis, as unidades de medida e o contexto dos dados.
Consulta aos Metadados: Se os dados forem desconhecidos ou complexos, consulte os metadados para uma compreensão detalhada das variáveis e da estrutura dos dados. Se não existirem metadados fale com alguem que conheça o dataset e o processo de geração de dados.
5.3.1 Exploração inicial
Estas primeiras funções não dirão muito mas permitem ter uma melhor compreensão ds dados que temos á frente.
Números de linhas
nrow(inpatient_hospital)[1] 7746Temos 7746 observações.
Número de Colunas
ncol(inpatient_hospital)[1] 7Temos 7 observações.
# esta função resume as duas questões anteriores
dim(inpatient_hospital)[1] 7746 7Para além do número de registos, podemos querer saber o nome e o tipo de variável importados.
Nome das colunas
colnames(inpatient_hospital)[1] "periodo" "regiao" "instituicao"
[4] "localizacao_geografica" "tipo_de_especialidade" "doentes_saidos"
[7] "dias_de_internamento" length(inpatient_hospital)[1] 7Nos dados originais temos 7 variáveis:
- periodo
- regiao
- instituicao
- tipo de especialidade
- localização geográfica
- dias de internamento
- doentes saidos
Tipo de Variável
str(inpatient_hospital)'data.frame': 7746 obs. of 7 variables:
$ periodo : chr "2015-01" "2015-01" "2015-01" "2015-01" ...
$ regiao : chr "Região de Saúde do Alentejo" "Região de Saúde do Centro" "Região de Saúde do Centro" "Região de Saúde do Centro" ...
$ instituicao : chr "Unidade Local de Saúde do Baixo Alentejo, EPE" "Centro Hospitalar Universitário Cova da Beira, EPE" "Centro Hospitalar do Baixo Vouga, EPE" "Instituto Português Oncologia de Coimbra, EPE" ...
$ localizacao_geografica: chr "38.014123, -7.8721227" "40.2804158, -7.4922407" "40.6362453, -8.6543716" "40.2162514, -8.4103814" ...
$ tipo_de_especialidade : chr "Especialidade Cirurgica" "Especialidade Cirurgica" "Especialidade Cirurgica" "Especialidade Cirurgica" ...
$ doentes_saidos : num 360 352 651 330 329 ...
$ dias_de_internamento : num 2026 2626 3958 2183 2640 ...Com os dados do str sabemos que:
Temos 4 variáveis nominais:
- periodo
- regiao
- instituicao
- localização geográfica
- tipo de especialidade
Temos duas variáveis numéricas:
- doentes saidos
- dias de internamentos
Embora as variáveis numéricas façam sentido, nas nominais podemos querer alterar algumas coisas:
- Mudar periodo para data
- Mudar a regiao, instituicao e tipo de especialidade para fatores para análises estatísticas subsequentes
- Para já não temos questões relativas à localização geográfica, por isso podemos remover esta variável
inpatient_hospital_lite <- inpatient_hospital |>
select(
-localizacao_geografica # remover localização
) |>
mutate(
periodo=paste0(periodo, "-01"), # modificar periodo para que possa ser lido como data
periodo=as.Date(periodo, format = "%Y-%m-%d"), #informar que periodo é data
regiao= as_factor(regiao), # existe uma função para fatores ordinais que é ordered() mas que neste caso não é útil
instituicao= as_factor(instituicao),
tipo_de_especialidade=as_factor(tipo_de_especialidade))Vamos confirmar as alterações com o str
str(inpatient_hospital_lite)'data.frame': 7746 obs. of 6 variables:
$ periodo : Date, format: "2015-01-01" "2015-01-01" ...
$ regiao : Factor w/ 5 levels "Região de Saúde do Alentejo",..: 1 2 2 2 2 3 4 4 4 4 ...
$ instituicao : Factor w/ 51 levels "Unidade Local de Saúde do Baixo Alentejo, EPE",..: 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 ...
$ tipo_de_especialidade: Factor w/ 2 levels "Especialidade Cirurgica",..: 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
$ doentes_saidos : num 360 352 651 330 329 ...
$ dias_de_internamento : num 2026 2626 3958 2183 2640 ...Agora já temos um melhor conhecimento sobre os dados:
- Uma variável de Data
- 3 variáveis são fatores
- Regiao com 5 valores possíveis
- Intituicão com 51 valores possíveis
- Tipo de especialidade com 2 valores posssíveis
5.3.2 Visualizar os dados
Uma boa prática numa primeira fase é visualizar pequenas porções dos dados para ver possíveis problemas imediatamente.
Função head() e tail()
Estas funções expõe n linhas dos dados.
Por default, são 5 linhas
head(inpatient_hospital_lite) periodo regiao
1 2015-01-01 Região de Saúde do Alentejo
2 2015-01-01 Região de Saúde do Centro
3 2015-01-01 Região de Saúde do Centro
4 2015-01-01 Região de Saúde do Centro
5 2015-01-01 Região de Saúde do Centro
6 2015-01-01 Região de Saúde LVT
instituicao tipo_de_especialidade
1 Unidade Local de Saúde do Baixo Alentejo, EPE Especialidade Cirurgica
2 Centro Hospitalar Universitário Cova da Beira, EPE Especialidade Cirurgica
3 Centro Hospitalar do Baixo Vouga, EPE Especialidade Cirurgica
4 Instituto Português Oncologia de Coimbra, EPE Especialidade Cirurgica
5 Unidade Local de Saúde da Guarda, EPE Especialidade Cirurgica
6 Centro Hospitalar de Setúbal, EPE Especialidade Cirurgica
doentes_saidos dias_de_internamento
1 360 2026
2 352 2626
3 651 3958
4 330 2183
5 329 2640
6 525 3442tail(inpatient_hospital_lite) periodo regiao
7741 2022-01-01 Região de Saúde LVT
7742 2022-01-01 Região de Saúde Norte
7743 2022-01-01 Região de Saúde Norte
7744 2022-01-01 Região de Saúde Norte
7745 2022-01-01 Região de Saúde Norte
7746 2022-01-01 Região de Saúde Norte
instituicao tipo_de_especialidade
7741 Instituto Português Oncologia de Lisboa, EPE Especialidade Médica
7742 Centro Hospitalar do Médio Ave, EPE Especialidade Médica
7743 Centro Hospitalar Trás-os-Montes e Alto Douro, EPE Especialidade Médica
7744 Hospital de Braga, EPE Especialidade Médica
7745 Instituto Português Oncologia do Porto, EPE Especialidade Médica
7746 Unidade Local de Saúde do Alto Minho, EPE Especialidade Médica
doentes_saidos dias_de_internamento
7741 491 3488
7742 361 4806
7743 1103 8243
7744 904 9555
7745 328 3239
7746 507 4631Pelos dados do Head e do Tail verificamos que os dados:
- Estão orientados de forma ascendente pelo período
- Parecem ir das Especialidade Cirúrgicas para as Médicas
- Os valores da variável dias de internamento parecem ser maiores
GT (preview)
Um dos maiores pacotes para geração de tabelas permite de forma simples fazer o mesmo que as funções head e tail numa tabela.
inpatient_hospital_lite |>
gt_preview(top_n=5, bottom_n = 5)| periodo | regiao | instituicao | tipo_de_especialidade | doentes_saidos | dias_de_internamento | |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2015-01-01 | Região de Saúde do Alentejo | Unidade Local de Saúde do Baixo Alentejo, EPE | Especialidade Cirurgica | 360 | 2026 |
| 2 | 2015-01-01 | Região de Saúde do Centro | Centro Hospitalar Universitário Cova da Beira, EPE | Especialidade Cirurgica | 352 | 2626 |
| 3 | 2015-01-01 | Região de Saúde do Centro | Centro Hospitalar do Baixo Vouga, EPE | Especialidade Cirurgica | 651 | 3958 |
| 4 | 2015-01-01 | Região de Saúde do Centro | Instituto Português Oncologia de Coimbra, EPE | Especialidade Cirurgica | 330 | 2183 |
| 5 | 2015-01-01 | Região de Saúde do Centro | Unidade Local de Saúde da Guarda, EPE | Especialidade Cirurgica | 329 | 2640 |
| 6..7741 | ||||||
| 7742 | 2022-01-01 | Região de Saúde Norte | Centro Hospitalar do Médio Ave, EPE | Especialidade Médica | 361 | 4806 |
| 7743 | 2022-01-01 | Região de Saúde Norte | Centro Hospitalar Trás-os-Montes e Alto Douro, EPE | Especialidade Médica | 1103 | 8243 |
| 7744 | 2022-01-01 | Região de Saúde Norte | Hospital de Braga, EPE | Especialidade Médica | 904 | 9555 |
| 7745 | 2022-01-01 | Região de Saúde Norte | Instituto Português Oncologia do Porto, EPE | Especialidade Médica | 328 | 3239 |
| 7746 | 2022-01-01 | Região de Saúde Norte | Unidade Local de Saúde do Alto Minho, EPE | Especialidade Médica | 507 | 4631 |
Summary
A função mais conhecia para a estatística descritiva no R, é o summary(), que dá a amplitude dos dados, a média e mediana dos dados, porém não mede o tamanho amostral total, o tipo de distribição nem disperção dos dados.
summary(inpatient_hospital_lite) periodo regiao
Min. :2015-01-01 Região de Saúde do Alentejo: 680
1st Qu.:2016-10-01 Região de Saúde do Centro :1797
Median :2018-07-01 Região de Saúde LVT :2465
Mean :2018-07-03 Região de Saúde Norte :2634
3rd Qu.:2020-04-01 Região de Saúde do Algarve : 170
Max. :2022-01-01
instituicao
Unidade Local de Saúde do Baixo Alentejo, EPE : 170
Centro Hospitalar Universitário Cova da Beira, EPE: 170
Centro Hospitalar do Baixo Vouga, EPE : 170
Instituto Português Oncologia de Coimbra, EPE : 170
Unidade Local de Saúde da Guarda, EPE : 170
Centro Hospitalar de Setúbal, EPE : 170
(Other) :6726
tipo_de_especialidade doentes_saidos dias_de_internamento
Especialidade Cirurgica:3740 Min. : 3 Min. : 46
Especialidade Médica :4006 1st Qu.: 1474 1st Qu.: 11770
Median : 3185 Median : 24957
Mean : 4374 Mean : 35756
3rd Qu.: 5909 3rd Qu.: 47372
Max. :34354 Max. :259313
NA's :2 Com mais esta função aprofundamos mais o nosso conhecimento dos dados:
A data vai de janeiro de 2015 a janeiro de 2022 e parece ser mensal que o ponto médio é julho de 2018
Existem mais registos de LVT e Norte (possivel razão?)
Parecem haver 170 registos por hospital
Existem mais registos de Especialidades Médicas do que de Cirúrgicas
Os doentes saídos têm 2 valores em falta
As distribuições das variáveis dos doentes saidos e dos dias de internamento têm uma variabilidade
Ver os números por hospital
inp_hosp_lite_count <- inpatient_hospital_lite |>
summarise(
count= n(),
total_patients= sum(doentes_saidos, na.rm = TRUE),
mean_patients = mean(doentes_saidos, na.rm = TRUE),
sd_patients = sd(doentes_saidos, na.rm = TRUE),
median_patients = median(doentes_saidos, na.rm = TRUE),
iqr_patients = IQR(doentes_saidos, na.rm = TRUE),
.by = instituicao) |>
arrange(count)
head(inp_hosp_lite_count) instituicao count
1 Hospital de Loures, EPE 2
2 Hospital Arcebispo João Crisóstomo 12
3 Hospital de Vila Franca de Xira, EPE 16
4 Hospital de Braga, EPE 58
5 Hospital de Magalhães Lemos, EPE 84
6 Centro Medicina de Reabilitação da Região Centro Rovisco Pais 85
total_patients mean_patients sd_patients median_patients iqr_patients
1 1126 563.0000 97.58074 563.0 69.00
2 744 62.0000 34.55431 70.0 54.75
3 68180 4261.2500 1929.67958 4445.0 2003.75
4 432750 7461.2069 4674.28320 7164.5 6967.25
5 114128 1358.6667 794.52631 1279.5 1272.50
6 11208 131.8588 75.14401 133.0 132.00Quais são algumas considerações que podemos fazer sobre estes dados?
5.3.3 Variação
A variação é a tendência dos dados variarem por medições consecutivas ou por sujeitos ou tempos.
Vamos explorar questões iniciais:
- Qual é a variação de doentes saídos por hospital
- Qual a diferença da distribuição de dados entre 2015 e 2022
- Qual é a variação dos dados por Tipo de Especialidade.
Como a variável doentes de doentes saidos é numérica podemos explorar a sua distribuição através do uso de histogramas. Em módulos futuros iremos explorar como fazer código e como melhorar gráficos apresentados.
O objetivo desta fase é explorar os valores mais típicos e procurar valores inesperados.
Perguntas desta fase podem ser:
- Quais são os valores mais comuns? Razões para isso?
- Quais valores são mais raros? Porquê serão?
- É possível observar algum padrão incomum?
Qual é a variação de doentes saídos por hospital
p1 <- inpatient_hospital_lite |>
ggplot(aes(x=doentes_saidos))+
geom_histogram(binwidth = 500)#isto cria um histograma com intervalos de 500 doentes
p1
Qual a diferença da distribuição de dados entre 2015 e 2022
p1 <- ggplot()+
geom_histogram(data=inpatient_hospital_lite |>
filter(periodo<"2016-01-01"),
aes(x=doentes_saidos),
binwidth = 500,
fill="blue",
alpha=0.5)+ #isto cria um histograma com intervalos de 500 doentes
geom_histogram(data=inpatient_hospital_lite |>
filter(periodo>"2021-01-01"),
aes(x=doentes_saidos),
binwidth = 500,
fill="red",
alpha=0.5)
p1
Os dados de 2021 aparentem ter uma maior frequência de valores mais baixos que 2015.
Qual é a variação dos dados por Tipo de Especialidade
p1 <- ggplot()+
geom_histogram(data=inpatient_hospital_lite |>
filter(tipo_de_especialidade=="Especialidade Médica"),
aes(x=doentes_saidos),
binwidth = 500,
fill="blue",
alpha=0.5)+#isto cria um histograma com intervalos de 500 doentes
geom_histogram(data=inpatient_hospital_lite |>
filter(tipo_de_especialidade=="Especialidade Cirurgica"),
aes(x=doentes_saidos),
binwidth = 500,
fill="red",
alpha=0.4)
p1
As Especialidades Médicas aparentem ter uma distribuição mais equilibrada de valores e os valores mais elevados parecem advir de valores de Especialidades Cirúrgicas.
Outras questões?
Existem padrões diferentes nos hospitais centrais e periféricos?
Existem diferenças entre os dados de Dezembro e de Junho?
5.3.4 Valores omissos
Para filtrarmos os dados em falta iremos utilizar a função is.na().
inpatient_hospital_na <- inpatient_hospital_lite |>
filter(is.na(doentes_saidos))
inpatient_hospital_na periodo regiao instituicao
1 2018-10-01 Região de Saúde do Centro Unidade Local de Saúde da Guarda, EPE
2 2018-10-01 Região de Saúde do Centro Unidade Local de Saúde da Guarda, EPE
tipo_de_especialidade doentes_saidos dias_de_internamento
1 Especialidade Médica NA 45164
2 Especialidade Cirurgica NA 21215Pela tabela podemos ver que a Unidade Local de Saúde da Guarda, EPE não reportou dados de doentes saidos.
Será porque foram 0? Sera porque não reportaram dados?
inpatient_hospital_zero <- inpatient_hospital_lite |>
filter(doentes_saidos<10)
inpatient_hospital_zero periodo regiao instituicao
1 2021-01-01 Região de Saúde do Centro Hospital Arcebispo João Crisóstomo
tipo_de_especialidade doentes_saidos dias_de_internamento
1 Especialidade Médica 3 49Não existem valore codificados para 0, sendo que o valor mínimo é de 3.
5.3.5 Valores incomuns (outliers)
Para efeitos de deteção de outliers foram consideradas todas as observações fora da equação abaixo.
\[ I=[q0.25−1.5⋅IQR;q0.75+1.5⋅IQR] \]
Tendo em conta os dados dos histogramas acima, vamo-nos focar nos dados de Especialidade Cirúrgica.
inpatient_hospital_outliers <- inpatient_hospital_lite |>
filter(tipo_de_especialidade=="Especialidade Cirurgica")
summary(inpatient_hospital_outliers) periodo regiao
Min. :2015-01-01 Região de Saúde do Alentejo: 340
1st Qu.:2016-10-01 Região de Saúde do Centro : 850
Median :2018-07-01 Região de Saúde LVT :1190
Mean :2018-07-01 Região de Saúde Norte :1275
3rd Qu.:2020-04-01 Região de Saúde do Algarve : 85
Max. :2022-01-01
instituicao
Unidade Local de Saúde do Baixo Alentejo, EPE : 85
Centro Hospitalar Universitário Cova da Beira, EPE: 85
Centro Hospitalar do Baixo Vouga, EPE : 85
Instituto Português Oncologia de Coimbra, EPE : 85
Unidade Local de Saúde da Guarda, EPE : 85
Centro Hospitalar de Setúbal, EPE : 85
(Other) :3230
tipo_de_especialidade doentes_saidos dias_de_internamento
Especialidade Cirurgica:3740 Min. : 11 Min. : 46
Especialidade Médica : 0 1st Qu.: 1578 1st Qu.: 9657
Median : 3333 Median : 20604
Mean : 4693 Mean : 29755
3rd Qu.: 6184 3rd Qu.: 37950
Max. :34354 Max. :240442
NA's :1 q25 <- 1578
q75 <- 6184
median <- 3333
iqr <- q75-q25
inpatient_hospital_outliers <- inpatient_hospital_lite |>
filter(doentes_saidos>median+1.5*iqr|doentes_saidos<median-1.5*iqr)
nrow(inpatient_hospital_outliers)[1] 627Existem 627 valores que são outliers.
q25 <- 1578
q75 <- 6184
median <- 3333
iqr <- q75-q25
inpatient_hospital_outliers <- inpatient_hospital_lite |>
filter(doentes_saidos>median+3*iqr|doentes_saidos<median-3*iqr)
nrow(inpatient_hospital_outliers)[1] 158Existem 158 valores que são outliers.
Vamos olhar para os valores superiores e ver que hospitais reportam estes valores.
q25 <- 1578
q75 <- 6184
median <- 3333
iqr <- q75-q25
inpatient_hospital_outliers_nome <- inpatient_hospital_lite |>
filter(doentes_saidos>median+3*iqr) |>
distinct(instituicao) |>
pull(instituicao)
inpatient_hospital_outliers_nome[1] Centro Hospitalar Universitário do Porto, EPE
[2] Centro Hospitalar Universitário Lisboa Central, EPE
[3] Centro Hospitalar e Universitário de Coimbra, EPE
[4] Centro Hospitalar Universitário de São João, EPE
[5] Hospital de Braga, EPE
[6] Centro Hospitalar Universitário de Lisboa Norte, EPE
51 Levels: Unidade Local de Saúde do Baixo Alentejo, EPE ...Existem 6 hospitiais que reportam valores outliers severos superiores.
- Centro Hospitalar Universitário do Porto, EPE
- Centro Hospitalar Universitário Lisboa Central, EPE
- Centro Hospitalar e Universitário de Coimbra, EPE
- Centro Hospitalar Universitário de São João, EPE
- Hospital de Braga, EPE
- Centro Hospitalar Universitário de Lisboa Norte, EPE
5.3.6 Covariação
A variação é o comportamento em relação a uma variável. A covariação é a tendência dos valores de uma varíavel estarem relacionados
Nesta aula iremos apenas uma forma de o fazer graficamente com um scatterplot com os dados de 2016.
ggplot(data = inpatient_hospital_lite |> filter(periodo<"2016-01-01"),
aes(x=doentes_saidos, y=dias_de_internamento)) +
geom_point(alpha=0.5) +
theme_minimal()
Parece existir uma tendência positiva entre os doentes saidos e os dias de internamentos.
5.4 Ferramentas de Exploração Rápida
5.4.1 SkimR
Para um EDA mais eficiente existem já pacotes criados como o Skimr.
Este pacote calcula logo:
- Número de dados em falta
- Média
- Mediana
- Desvio-Padrão
- Q0, Q25, Q50, Q75 e Q100
skim(inpatient_hospital_lite)| Name | inpatient_hospital_lite |
| Number of rows | 7746 |
| Number of columns | 6 |
| _______________________ | |
| Column type frequency: | |
| Date | 1 |
| factor | 3 |
| numeric | 2 |
| ________________________ | |
| Group variables | None |
Variable type: Date
| skim_variable | n_missing | complete_rate | min | max | median | n_unique |
|---|---|---|---|---|---|---|
| periodo | 0 | 1 | 2015-01-01 | 2022-01-01 | 2018-07-01 | 85 |
Variable type: factor
| skim_variable | n_missing | complete_rate | ordered | n_unique | top_counts |
|---|---|---|---|---|---|
| regiao | 0 | 1 | FALSE | 5 | Reg: 2634, Reg: 2465, Reg: 1797, Reg: 680 |
| instituicao | 0 | 1 | FALSE | 51 | Uni: 170, Cen: 170, Cen: 170, Ins: 170 |
| tipo_de_especialidade | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 4006, Esp: 3740 |
Variable type: numeric
| skim_variable | n_missing | complete_rate | mean | sd | p0 | p25 | p50 | p75 | p100 | hist |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| doentes_saidos | 2 | 1 | 4374.48 | 4197.93 | 3 | 1473.75 | 3185 | 5909.0 | 34354 | ▇▂▁▁▁ |
| dias_de_internamento | 0 | 1 | 35756.06 | 35219.47 | 46 | 11770.25 | 24957 | 47371.5 | 259313 | ▇▂▁▁▁ |
Por Especialidade
inpatient_hospital_lite |>
group_by(tipo_de_especialidade) |>
select(-dias_de_internamento, -periodo) |>
skim()| Name | select(…) |
| Number of rows | 7746 |
| Number of columns | 4 |
| _______________________ | |
| Column type frequency: | |
| factor | 2 |
| numeric | 1 |
| ________________________ | |
| Group variables | tipo_de_especialidade |
Variable type: factor
| skim_variable | tipo_de_especialidade | n_missing | complete_rate | ordered | n_unique | top_counts |
|---|---|---|---|---|---|---|
| regiao | Especialidade Cirurgica | 0 | 1 | FALSE | 5 | Reg: 1275, Reg: 1190, Reg: 850, Reg: 340 |
| regiao | Especialidade Médica | 0 | 1 | FALSE | 5 | Reg: 1359, Reg: 1275, Reg: 947, Reg: 340 |
| instituicao | Especialidade Cirurgica | 0 | 1 | FALSE | 47 | Uni: 85, Cen: 85, Cen: 85, Ins: 85 |
| instituicao | Especialidade Médica | 0 | 1 | FALSE | 51 | Uni: 85, Cen: 85, Cen: 85, Ins: 85 |
Variable type: numeric
| skim_variable | tipo_de_especialidade | n_missing | complete_rate | mean | sd | p0 | p25 | p50 | p75 | p100 | hist |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| doentes_saidos | Especialidade Cirurgica | 1 | 1 | 4693.22 | 4658.64 | 11 | 1577.5 | 3333 | 6183.5 | 34354 | ▇▂▁▁▁ |
| doentes_saidos | Especialidade Médica | 1 | 1 | 4076.91 | 3692.47 | 3 | 1419.0 | 3056 | 5726.0 | 26335 | ▇▂▁▁▁ |
Por instituição
inpatient_hospital_lite |>
group_by(instituicao) |>
select(-dias_de_internamento, -periodo) |>
skim()| Name | select(…) |
| Number of rows | 7746 |
| Number of columns | 4 |
| _______________________ | |
| Column type frequency: | |
| factor | 2 |
| numeric | 1 |
| ________________________ | |
| Group variables | instituicao |
Variable type: factor
| skim_variable | instituicao | n_missing | complete_rate | ordered | n_unique | top_counts |
|---|---|---|---|---|---|---|
| regiao | Unidade Local de Saúde do Baixo Alentejo, EPE | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 170, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Centro Hospitalar Universitário Cova da Beira, EPE | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 170, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Centro Hospitalar do Baixo Vouga, EPE | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 170, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Instituto Português Oncologia de Coimbra, EPE | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 170, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Unidade Local de Saúde da Guarda, EPE | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 170, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Centro Hospitalar de Setúbal, EPE | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 170, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Centro Hospitalar Universitário de São João, EPE | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 170, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Centro Hospitalar do Médio Ave, EPE | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 170, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Centro Hospitalar Entre Douro e Vouga, EPE | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 170, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Hospital Santa Maria Maior, EPE | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 170, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Centro Hospitalar Universitário do Algarve,EPE | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 170, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Hospital Dr. Francisco Zagalo | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 170, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Unidade Local de Saúde de Castelo Branco, EPE | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 170, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Centro Hospitalar de Lisboa Ocidental, EPE | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 170, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Hospital Garcia de Orta, EPE | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 170, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Centro Hospitalar Universitário do Porto, EPE | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 170, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Hospital da Senhora da Oliveira, Guimarães, EPE | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 170, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Instituto Português Oncologia do Porto, EPE | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 170, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Unidade Local de Saúde do Alto Minho, EPE | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 170, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Unidade Local de Saúde do Nordeste, EPE | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 170, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Centro Hospitalar Tondela-Viseu, EPE | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 170, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Centro Hospitalar Médio Tejo, EPE | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 170, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Centro Hospitalar Tâmega e Sousa, EPE | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 170, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Centro Hospitalar Trás-os-Montes e Alto Douro, EPE | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 170, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Hospital de Braga, PPP | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 112, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Unidade Local de Saúde do Norte Alentejano, EPE | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 170, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Centro Hospitalar e Universitário de Coimbra, EPE | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 170, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Unidade Local de Saúde do Litoral Alentejano, EPE | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 170, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Centro Hospitalar Barreiro/Montijo, EPE | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 170, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Hospital de Loures, PPP | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 168, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Instituto Português Oncologia de Lisboa, EPE | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 170, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Hospital de Vila Franca de Xira, PPP | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 154, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Centro Hospitalar Universitário Lisboa Central, EPE | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 170, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Unidade Local de Saúde de Matosinhos, EPE | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 170, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Hospital Distrital de Santarém, EPE | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 170, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Hospital de Cascais, PPP | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 170, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Centro Hospitalar Vila Nova de Gaia/Espinho, EPE | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 170, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Centro Hospitalar do Oeste, EPE | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 170, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Centro Hospitalar Universitário de Lisboa Norte, EPE | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 170, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Hospital Professor Doutor Fernando Fonseca, EPE | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 170, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Hospital Espírito Santo de Évora, EPE | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 170, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Centro Hospitalar Póvoa de Varzim/Vila do Conde, EPE | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 170, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Centro Hospitalar de Leiria, EPE | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 170, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Hospital Distrital da Figueira da Foz, EPE | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 170, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Hospital de Braga, EPE | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 58, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Centro Medicina de Reabilitação da Região Centro Rovisco Pais | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 85, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Hospital de Magalhães Lemos, EPE | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 84, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Centro Hospitalar Psiquiátrico de Lisboa | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 85, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Hospital Arcebispo João Crisóstomo | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 12, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Hospital de Vila Franca de Xira, EPE | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 16, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| regiao | Hospital de Loures, EPE | 0 | 1 | FALSE | 1 | Reg: 2, Reg: 0, Reg: 0, Reg: 0 |
| tipo_de_especialidade | Unidade Local de Saúde do Baixo Alentejo, EPE | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 85, Esp: 85 |
| tipo_de_especialidade | Centro Hospitalar Universitário Cova da Beira, EPE | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 85, Esp: 85 |
| tipo_de_especialidade | Centro Hospitalar do Baixo Vouga, EPE | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 85, Esp: 85 |
| tipo_de_especialidade | Instituto Português Oncologia de Coimbra, EPE | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 85, Esp: 85 |
| tipo_de_especialidade | Unidade Local de Saúde da Guarda, EPE | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 85, Esp: 85 |
| tipo_de_especialidade | Centro Hospitalar de Setúbal, EPE | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 85, Esp: 85 |
| tipo_de_especialidade | Centro Hospitalar Universitário de São João, EPE | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 85, Esp: 85 |
| tipo_de_especialidade | Centro Hospitalar do Médio Ave, EPE | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 85, Esp: 85 |
| tipo_de_especialidade | Centro Hospitalar Entre Douro e Vouga, EPE | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 85, Esp: 85 |
| tipo_de_especialidade | Hospital Santa Maria Maior, EPE | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 85, Esp: 85 |
| tipo_de_especialidade | Centro Hospitalar Universitário do Algarve,EPE | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 85, Esp: 85 |
| tipo_de_especialidade | Hospital Dr. Francisco Zagalo | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 85, Esp: 85 |
| tipo_de_especialidade | Unidade Local de Saúde de Castelo Branco, EPE | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 85, Esp: 85 |
| tipo_de_especialidade | Centro Hospitalar de Lisboa Ocidental, EPE | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 85, Esp: 85 |
| tipo_de_especialidade | Hospital Garcia de Orta, EPE | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 85, Esp: 85 |
| tipo_de_especialidade | Centro Hospitalar Universitário do Porto, EPE | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 85, Esp: 85 |
| tipo_de_especialidade | Hospital da Senhora da Oliveira, Guimarães, EPE | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 85, Esp: 85 |
| tipo_de_especialidade | Instituto Português Oncologia do Porto, EPE | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 85, Esp: 85 |
| tipo_de_especialidade | Unidade Local de Saúde do Alto Minho, EPE | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 85, Esp: 85 |
| tipo_de_especialidade | Unidade Local de Saúde do Nordeste, EPE | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 85, Esp: 85 |
| tipo_de_especialidade | Centro Hospitalar Tondela-Viseu, EPE | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 85, Esp: 85 |
| tipo_de_especialidade | Centro Hospitalar Médio Tejo, EPE | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 85, Esp: 85 |
| tipo_de_especialidade | Centro Hospitalar Tâmega e Sousa, EPE | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 85, Esp: 85 |
| tipo_de_especialidade | Centro Hospitalar Trás-os-Montes e Alto Douro, EPE | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 85, Esp: 85 |
| tipo_de_especialidade | Hospital de Braga, PPP | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 56, Esp: 56 |
| tipo_de_especialidade | Unidade Local de Saúde do Norte Alentejano, EPE | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 85, Esp: 85 |
| tipo_de_especialidade | Centro Hospitalar e Universitário de Coimbra, EPE | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 85, Esp: 85 |
| tipo_de_especialidade | Unidade Local de Saúde do Litoral Alentejano, EPE | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 85, Esp: 85 |
| tipo_de_especialidade | Centro Hospitalar Barreiro/Montijo, EPE | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 85, Esp: 85 |
| tipo_de_especialidade | Hospital de Loures, PPP | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 84, Esp: 84 |
| tipo_de_especialidade | Instituto Português Oncologia de Lisboa, EPE | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 85, Esp: 85 |
| tipo_de_especialidade | Hospital de Vila Franca de Xira, PPP | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 77, Esp: 77 |
| tipo_de_especialidade | Centro Hospitalar Universitário Lisboa Central, EPE | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 85, Esp: 85 |
| tipo_de_especialidade | Unidade Local de Saúde de Matosinhos, EPE | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 85, Esp: 85 |
| tipo_de_especialidade | Hospital Distrital de Santarém, EPE | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 85, Esp: 85 |
| tipo_de_especialidade | Hospital de Cascais, PPP | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 85, Esp: 85 |
| tipo_de_especialidade | Centro Hospitalar Vila Nova de Gaia/Espinho, EPE | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 85, Esp: 85 |
| tipo_de_especialidade | Centro Hospitalar do Oeste, EPE | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 85, Esp: 85 |
| tipo_de_especialidade | Centro Hospitalar Universitário de Lisboa Norte, EPE | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 85, Esp: 85 |
| tipo_de_especialidade | Hospital Professor Doutor Fernando Fonseca, EPE | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 85, Esp: 85 |
| tipo_de_especialidade | Hospital Espírito Santo de Évora, EPE | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 85, Esp: 85 |
| tipo_de_especialidade | Centro Hospitalar Póvoa de Varzim/Vila do Conde, EPE | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 85, Esp: 85 |
| tipo_de_especialidade | Centro Hospitalar de Leiria, EPE | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 85, Esp: 85 |
| tipo_de_especialidade | Hospital Distrital da Figueira da Foz, EPE | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 85, Esp: 85 |
| tipo_de_especialidade | Hospital de Braga, EPE | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 29, Esp: 29 |
| tipo_de_especialidade | Centro Medicina de Reabilitação da Região Centro Rovisco Pais | 0 | 1 | FALSE | 1 | Esp: 85, Esp: 0 |
| tipo_de_especialidade | Hospital de Magalhães Lemos, EPE | 0 | 1 | FALSE | 1 | Esp: 84, Esp: 0 |
| tipo_de_especialidade | Centro Hospitalar Psiquiátrico de Lisboa | 0 | 1 | FALSE | 1 | Esp: 85, Esp: 0 |
| tipo_de_especialidade | Hospital Arcebispo João Crisóstomo | 0 | 1 | FALSE | 1 | Esp: 12, Esp: 0 |
| tipo_de_especialidade | Hospital de Vila Franca de Xira, EPE | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 8, Esp: 8 |
| tipo_de_especialidade | Hospital de Loures, EPE | 0 | 1 | FALSE | 2 | Esp: 1, Esp: 1 |
Variable type: numeric
| skim_variable | instituicao | n_missing | complete_rate | mean | sd | p0 | p25 | p50 | p75 | p100 | hist |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| doentes_saidos | Unidade Local de Saúde do Baixo Alentejo, EPE | 0 | 1.00 | 2018.19 | 1105.14 | 263 | 1069.50 | 1989.0 | 2877.75 | 4342 | ▇▇▇▆▃ |
| doentes_saidos | Centro Hospitalar Universitário Cova da Beira, EPE | 0 | 1.00 | 2592.31 | 1494.47 | 183 | 1358.75 | 2554.5 | 3677.75 | 6669 | ▇▇▇▅▁ |
| doentes_saidos | Centro Hospitalar do Baixo Vouga, EPE | 0 | 1.00 | 4048.38 | 2230.78 | 393 | 2136.50 | 3924.5 | 5780.25 | 9202 | ▇▇▇▆▂ |
| doentes_saidos | Instituto Português Oncologia de Coimbra, EPE | 0 | 1.00 | 1508.82 | 1011.57 | 98 | 672.50 | 1320.5 | 2103.75 | 4057 | ▇▇▅▃▂ |
| doentes_saidos | Unidade Local de Saúde da Guarda, EPE | 2 | 0.99 | 2245.76 | 1341.49 | 152 | 1129.75 | 2173.5 | 3221.75 | 5537 | ▇▇▇▃▂ |
| doentes_saidos | Centro Hospitalar de Setúbal, EPE | 0 | 1.00 | 3627.41 | 2047.63 | 265 | 1995.75 | 3525.0 | 5217.75 | 8037 | ▇▇▇▆▃ |
| doentes_saidos | Centro Hospitalar Universitário de São João, EPE | 0 | 1.00 | 10669.81 | 6646.05 | 1158 | 5287.00 | 9755.5 | 14881.25 | 26691 | ▇▇▆▂▂ |
| doentes_saidos | Centro Hospitalar do Médio Ave, EPE | 0 | 1.00 | 2578.92 | 1499.06 | 316 | 1380.50 | 2466.5 | 3581.75 | 6770 | ▇▇▇▃▁ |
| doentes_saidos | Centro Hospitalar Entre Douro e Vouga, EPE | 0 | 1.00 | 4612.49 | 2763.49 | 526 | 2399.00 | 4355.0 | 6372.75 | 12310 | ▇▇▆▂▁ |
| doentes_saidos | Hospital Santa Maria Maior, EPE | 0 | 1.00 | 1388.47 | 788.86 | 134 | 748.25 | 1366.0 | 1963.25 | 3174 | ▇▇▇▅▃ |
| doentes_saidos | Centro Hospitalar Universitário do Algarve,EPE | 0 | 1.00 | 7312.89 | 3991.64 | 861 | 3831.75 | 7201.0 | 10706.00 | 14314 | ▇▇▆▆▇ |
| doentes_saidos | Hospital Dr. Francisco Zagalo | 0 | 1.00 | 198.41 | 112.39 | 11 | 102.75 | 196.0 | 283.75 | 498 | ▇▇▇▅▁ |
| doentes_saidos | Unidade Local de Saúde de Castelo Branco, EPE | 0 | 1.00 | 1950.35 | 1075.22 | 185 | 1026.75 | 1933.5 | 2815.50 | 3996 | ▇▇▇▇▅ |
| doentes_saidos | Centro Hospitalar de Lisboa Ocidental, EPE | 0 | 1.00 | 6090.53 | 3323.78 | 698 | 3230.75 | 5966.5 | 8673.25 | 12912 | ▇▇▇▇▃ |
| doentes_saidos | Hospital Garcia de Orta, EPE | 0 | 1.00 | 5030.92 | 2836.34 | 549 | 2670.00 | 4910.0 | 7227.00 | 11366 | ▇▇▇▆▂ |
| doentes_saidos | Centro Hospitalar Universitário do Porto, EPE | 0 | 1.00 | 7879.96 | 5058.62 | 860 | 3689.50 | 6942.5 | 10299.75 | 20510 | ▇▇▅▂▂ |
| doentes_saidos | Hospital da Senhora da Oliveira, Guimarães, EPE | 0 | 1.00 | 5304.49 | 2874.93 | 565 | 2857.00 | 5272.5 | 7667.75 | 10664 | ▇▇▆▇▅ |
| doentes_saidos | Instituto Português Oncologia do Porto, EPE | 0 | 1.00 | 2918.21 | 1659.30 | 328 | 1576.50 | 2787.0 | 4196.50 | 6451 | ▇▇▇▆▃ |
| doentes_saidos | Unidade Local de Saúde do Alto Minho, EPE | 0 | 1.00 | 4274.19 | 2379.87 | 357 | 2304.25 | 4232.0 | 6112.75 | 9489 | ▇▇▆▆▂ |
| doentes_saidos | Unidade Local de Saúde do Nordeste, EPE | 0 | 1.00 | 2737.38 | 1505.43 | 236 | 1495.75 | 2722.5 | 3945.00 | 5914 | ▇▇▇▆▃ |
| doentes_saidos | Centro Hospitalar Tondela-Viseu, EPE | 0 | 1.00 | 5318.63 | 2912.84 | 568 | 2897.00 | 5312.0 | 7775.50 | 11056 | ▇▇▇▇▅ |
| doentes_saidos | Centro Hospitalar Médio Tejo, EPE | 0 | 1.00 | 4033.18 | 2277.49 | 334 | 2151.25 | 3909.0 | 5828.50 | 9031 | ▇▇▇▆▃ |
| doentes_saidos | Centro Hospitalar Tâmega e Sousa, EPE | 0 | 1.00 | 5437.71 | 2961.36 | 686 | 2847.50 | 5420.5 | 7831.75 | 11990 | ▇▇▇▆▂ |
| doentes_saidos | Centro Hospitalar Trás-os-Montes e Alto Douro, EPE | 0 | 1.00 | 6156.22 | 3523.32 | 554 | 3189.00 | 5992.5 | 8719.25 | 14358 | ▇▇▇▅▂ |
| doentes_saidos | Hospital de Braga, PPP | 0 | 1.00 | 7046.74 | 4151.97 | 958 | 3850.75 | 6581.5 | 9709.25 | 16783 | ▇▆▆▃▂ |
| doentes_saidos | Unidade Local de Saúde do Norte Alentejano, EPE | 0 | 1.00 | 1963.63 | 1063.67 | 181 | 1064.50 | 1968.0 | 2812.50 | 4407 | ▇▇▇▇▂ |
| doentes_saidos | Centro Hospitalar e Universitário de Coimbra, EPE | 0 | 1.00 | 14715.06 | 8365.37 | 1610 | 7894.25 | 14047.0 | 21051.25 | 34354 | ▇▇▇▆▂ |
| doentes_saidos | Unidade Local de Saúde do Litoral Alentejano, EPE | 0 | 1.00 | 1276.24 | 740.47 | 72 | 664.75 | 1224.5 | 1836.25 | 2855 | ▇▇▇▅▃ |
| doentes_saidos | Centro Hospitalar Barreiro/Montijo, EPE | 0 | 1.00 | 2725.27 | 1481.83 | 243 | 1414.75 | 2706.5 | 3925.75 | 5763 | ▇▇▇▇▃ |
| doentes_saidos | Hospital de Loures, PPP | 0 | 1.00 | 4653.85 | 2459.21 | 370 | 2553.75 | 4562.0 | 6577.75 | 9670 | ▇▇▇▇▅ |
| doentes_saidos | Instituto Português Oncologia de Lisboa, EPE | 0 | 1.00 | 3215.51 | 1864.28 | 371 | 1716.00 | 3106.0 | 4632.00 | 7419 | ▇▆▆▅▂ |
| doentes_saidos | Hospital de Vila Franca de Xira, PPP | 0 | 1.00 | 3621.82 | 1999.13 | 324 | 1987.00 | 3498.0 | 5250.25 | 7582 | ▇▇▇▇▅ |
| doentes_saidos | Centro Hospitalar Universitário Lisboa Central, EPE | 0 | 1.00 | 11130.93 | 6422.79 | 1238 | 5910.25 | 10864.0 | 15832.00 | 26164 | ▇▇▆▅▂ |
| doentes_saidos | Unidade Local de Saúde de Matosinhos, EPE | 0 | 1.00 | 4007.21 | 2230.22 | 486 | 2125.50 | 3992.0 | 5754.25 | 9248 | ▇▇▇▆▂ |
| doentes_saidos | Hospital Distrital de Santarém, EPE | 0 | 1.00 | 3893.05 | 2230.84 | 307 | 2057.00 | 3820.5 | 5483.25 | 9110 | ▇▇▇▅▂ |
| doentes_saidos | Hospital de Cascais, PPP | 0 | 1.00 | 3071.74 | 1741.77 | 366 | 1678.75 | 2940.0 | 4406.25 | 6918 | ▇▇▆▅▃ |
| doentes_saidos | Centro Hospitalar Vila Nova de Gaia/Espinho, EPE | 0 | 1.00 | 5638.11 | 3497.70 | 629 | 2883.50 | 5218.5 | 7661.00 | 14194 | ▇▇▆▂▂ |
| doentes_saidos | Centro Hospitalar do Oeste, EPE | 0 | 1.00 | 3577.28 | 1931.76 | 294 | 1962.25 | 3629.0 | 5179.75 | 7425 | ▇▇▇▇▅ |
| doentes_saidos | Centro Hospitalar Universitário de Lisboa Norte, EPE | 0 | 1.00 | 9519.88 | 5297.41 | 864 | 5255.75 | 9256.5 | 13537.00 | 21581 | ▇▇▇▆▂ |
| doentes_saidos | Hospital Professor Doutor Fernando Fonseca, EPE | 0 | 1.00 | 6637.99 | 3707.73 | 521 | 3663.50 | 6479.5 | 9514.50 | 14660 | ▇▇▇▆▃ |
| doentes_saidos | Hospital Espírito Santo de Évora, EPE | 0 | 1.00 | 2864.96 | 1550.24 | 267 | 1532.00 | 2833.0 | 4085.25 | 6096 | ▇▇▇▇▃ |
| doentes_saidos | Centro Hospitalar Póvoa de Varzim/Vila do Conde, EPE | 0 | 1.00 | 1915.51 | 1175.49 | 217 | 1016.50 | 1779.5 | 2574.25 | 4904 | ▇▇▆▂▂ |
| doentes_saidos | Centro Hospitalar de Leiria, EPE | 0 | 1.00 | 5219.10 | 2890.87 | 433 | 2727.75 | 5097.5 | 7502.50 | 11075 | ▇▇▇▇▅ |
| doentes_saidos | Hospital Distrital da Figueira da Foz, EPE | 0 | 1.00 | 1319.75 | 719.52 | 119 | 690.25 | 1340.5 | 1870.75 | 2953 | ▇▇▇▇▂ |
| doentes_saidos | Hospital de Braga, EPE | 0 | 1.00 | 7461.21 | 4674.28 | 879 | 3525.75 | 7164.5 | 10493.00 | 18196 | ▇▆▆▃▂ |
| doentes_saidos | Centro Medicina de Reabilitação da Região Centro Rovisco Pais | 0 | 1.00 | 131.86 | 75.14 | 14 | 65.00 | 133.0 | 197.00 | 277 | ▇▆▆▇▃ |
| doentes_saidos | Hospital de Magalhães Lemos, EPE | 0 | 1.00 | 1358.67 | 794.53 | 128 | 691.25 | 1279.5 | 1963.75 | 2910 | ▇▇▇▅▅ |
| doentes_saidos | Centro Hospitalar Psiquiátrico de Lisboa | 0 | 1.00 | 908.85 | 509.92 | 15 | 489.00 | 884.0 | 1294.00 | 1908 | ▆▇▇▆▅ |
| doentes_saidos | Hospital Arcebispo João Crisóstomo | 0 | 1.00 | 62.00 | 34.55 | 3 | 37.00 | 70.0 | 91.75 | 99 | ▃▃▂▃▇ |
| doentes_saidos | Hospital de Vila Franca de Xira, EPE | 0 | 1.00 | 4261.25 | 1929.68 | 429 | 3511.25 | 4445.0 | 5515.00 | 7267 | ▃▃▆▇▅ |
| doentes_saidos | Hospital de Loures, EPE | 0 | 1.00 | 563.00 | 97.58 | 494 | 528.50 | 563.0 | 597.50 | 632 | ▇▁▁▁▇ |
5.4.2 DataExplorer
O pacote Data Explorer tem uma função entitulada create_report que cria uma html baseado num dataset.
É possível definir uma variável de reposta, como um outcome que estejamos a procura de modelar.
create_report(
data=inpatient_hospital_lite,
y = "doentes_saidos",
output_file = "reportDataExplorer.html",
output_dir = paste0(getwd(),"/output/documents"),
report_title = "Relatório de Exploração dos Dados",
)
|
| | 0%
|
|. | 2%
|
|.. | 5% [global_options]
|
|... | 7%
|
|.... | 10% [introduce]
|
|.... | 12%
|
|..... | 14% [plot_intro]
|
|...... | 17%
|
|....... | 19% [data_structure]
|
|........ | 21%
|
|......... | 24% [missing_profile]
|
|.......... | 26%
|
|........... | 29% [univariate_distribution_header]
|
|........... | 31%
|
|............ | 33% [plot_histogram]
|
|............. | 36%
|
|.............. | 38% [plot_density]
|
|............... | 40%
|
|................ | 43% [plot_frequency_bar]
|
|................. | 45%
|
|.................. | 48% [plot_response_bar]
|
|.................. | 50%
|
|................... | 52% [plot_with_bar]
|
|.................... | 55%
|
|..................... | 57% [plot_normal_qq]
|
|...................... | 60%
|
|....................... | 62% [plot_response_qq]
|
|........................ | 64%
|
|......................... | 67% [plot_by_qq]
|
|.......................... | 69%
|
|.......................... | 71% [correlation_analysis]
|
|........................... | 74%
|
|............................ | 76% [principal_component_analysis]
|
|............................. | 79%
|
|.............................. | 81% [bivariate_distribution_header]
|
|............................... | 83%
|
|................................ | 86% [plot_response_boxplot]
|
|................................. | 88%
|
|................................. | 90% [plot_by_boxplot]
|
|.................................. | 93%
|
|................................... | 95% [plot_response_scatterplot]
|
|.................................... | 98%
|
|.....................................| 100% [plot_by_scatterplot]
"C:/Program Files/RStudio/resources/app/bin/quarto/bin/tools/pandoc" +RTS -K512m -RTS "E:\RProjects\Projects\data_science_book1\output\documents\report.knit.md" --to html4 --from markdown+autolink_bare_uris+tex_math_single_backslash --output pandoc5b405c7719ca.html --lua-filter "C:\Users\jdrdionisio\AppData\Local\R\win-library\4.2\rmarkdown\rmarkdown\lua\pagebreak.lua" --lua-filter "C:\Users\jdrdionisio\AppData\Local\R\win-library\4.2\rmarkdown\rmarkdown\lua\latex-div.lua" --embed-resources --standalone --variable bs3=TRUE --section-divs --table-of-contents --toc-depth 6 --template "C:\Users\jdrdionisio\AppData\Local\R\win-library\4.2\rmarkdown\rmd\h\default.html" --no-highlight --variable highlightjs=1 --variable theme=yeti --mathjax --variable "mathjax-url=https://mathjax.rstudio.com/latest/MathJax.js?config=TeX-AMS-MML_HTMLorMML" --include-in-header "C:\Users\JDRDIO~1\AppData\Local\Temp\Rtmpm8Lz4F\rmarkdown-str5b407864d9a.html" As ferramentas apenas automatizam algum código, dependo do utilizador para a interpretação dos dados.